Ik heb nooit aquaponics gebruikt, maar het kost veel vissen om simpele planten zoals basilicum of peterselie te onderhouden. Dus volgens mij zou je tegen een tekort aan voedingsstoffen kunnen aanlopen. Ik denk ook dat je niet zult kunnen weten welke voedingsstoffen door de vissen worden aangeleverd: je weet het niveau van de voedingsstoffen, maar niet de samenstelling van de voedingsstoffen, dus misschien heb je bijvoorbeeld niet genoeg Pk voor de bloei. Het laatste punt voor mij is dat je te maken kunt krijgen met pH-schommelingen door de behoeften van de planten en de vissen, maar het is niets moeilijks te beheren voor iemand die al een tijdje vissen heeft.